Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIOK1Q9BRS2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms