Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PKP2Q99959 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PKP2Q99959 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms