Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EIF3CQ99613 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EIF3CQ99613 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms