Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP1Q99575 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP1Q99575 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP1Q99575 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP1Q99575 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POP1Q99575 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP1Q99575 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POP1Q99575 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP1Q99575 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP1Q99575 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP1Q99575 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP1Q99575 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP1Q99575 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP1Q99575 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP1Q99575 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POP1Q99575 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP1Q99575 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP1Q99575 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP1Q99575 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP1Q99575 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP1Q99575 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP1Q99575 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP1Q99575 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP1Q99575 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POP1Q99575 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP1Q99575 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP1Q99575 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POP1Q99575 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP1Q99575 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP1Q99575 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POP1Q99575 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP1Q99575 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POP1Q99575 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POP1Q99575 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP1Q99575 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP1Q99575 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP1Q99575 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP1Q99575 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP1Q99575 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP1Q99575 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP1Q99575 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POP1Q99575 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP1Q99575 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP1Q99575 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP1Q99575 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP1Q99575 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POP1Q99575 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP1Q99575 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP1Q99575 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP1Q99575 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP1Q99575 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP1Q99575 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP1Q99575 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP1Q99575 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP1Q99575 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP1Q99575 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP1Q99575 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP1Q99575 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP1Q99575 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP1Q99575 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP1Q99575 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP1Q99575 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP1Q99575 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POP1Q99575 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP1Q99575 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP1Q99575 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP1Q99575 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP1Q99575 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP1Q99575 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP1Q99575 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP1Q99575 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP1Q99575 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP1Q99575 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP1Q99575 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP1Q99575 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP1Q99575 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP1Q99575 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP1Q99575 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP1Q99575 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POP1Q99575 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP1Q99575 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP1Q99575 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP1Q99575 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP1Q99575 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP1Q99575 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP1Q99575 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP1Q99575 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP1Q99575 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POP1Q99575 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP1Q99575 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP1Q99575 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP1Q99575 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POP1Q99575 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP1Q99575 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP1Q99575 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP1Q99575 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP1Q99575 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP1Q99575 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POP1Q99575 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POP1Q99575 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms