Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCGB3A2Q96PL1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms