Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF488Q96MN9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms