Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf72Q96LT7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C9orf72Q96LT7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf72Q96LT7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf72Q96LT7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf72Q96LT7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf72Q96LT7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf72Q96LT7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf72Q96LT7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf72Q96LT7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf72Q96LT7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf72Q96LT7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf72Q96LT7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf72Q96LT7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf72Q96LT7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf72Q96LT7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf72Q96LT7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C9orf72Q96LT7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf72Q96LT7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms