Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EP400Q96L91 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EP400Q96L91 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms