Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms