Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC136Q96JN2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC136Q96JN2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.8 ms