Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMARCD1Q96GM5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms