Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL1Q96FI4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL1Q96FI4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms