Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms