Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MALSU1Q96EH3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms