Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PGBD4Q96DM1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms