Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMD3Q96D46 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMD3Q96D46 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms