Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms