Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms