Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM0

NUP133, Nuclear pore complex protein Nup133, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133Q8WUM0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP133Q8WUM0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP133Q8WUM0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms