Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms