Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP35Q8NFH5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NUP35Q8NFH5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms