Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms