Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMYD4Q8IYR2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMYD4Q8IYR2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms