Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC83Q8IWF9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC83Q8IWF9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms