Protein–RNA interactions for Protein: Q86YR7

MCF2L2, Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2L2Q86YR7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCF2L2Q86YR7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms