Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLNKQ7Z7G1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLNKQ7Z7G1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLNKQ7Z7G1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLNKQ7Z7G1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLNKQ7Z7G1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLNKQ7Z7G1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLNKQ7Z7G1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLNKQ7Z7G1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLNKQ7Z7G1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLNKQ7Z7G1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms