Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PAXIP1Q6ZW49 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAXIP1Q6ZW49 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms