Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP6Q6ZN66 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GBP6Q6ZN66 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms