Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXU4

GSG1L, Germ cell-specific gene 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSG1LQ6UXU4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GSG1LQ6UXU4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSG1LQ6UXU4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms