Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP1Q6PKG0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms