Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms