Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 UBE2E1-203ENST00000424381 1224 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.183e-20■■■■■ 39.8
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PRPF8Q6P2Q9 PDK1-209ENST00000466437 599 ntTSL 47.27□□□□□ -1.254e-10■■■■■ 39.8
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PRPF8Q6P2Q9 MUTYH-227ENST00000483127 788 ntTSL 56.47□□□□□ -1.373e-20■■■■■ 39.8
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PRPF8Q6P2Q9 APOL2-201ENST00000249066 2685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.317e-8■■■■■ 39.6
PRPF8Q6P2Q9 APOL2-202ENST00000358502 2551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.317e-8■■■■■ 39.6
PRPF8Q6P2Q9 PUM3-201ENST00000382032 458 ntTSL 22.51□□□□□ -2.011e-29■■■■■ 39.6
PRPF8Q6P2Q9 PUM3-204ENST00000490444 340 ntTSL 50.95□□□□□ -2.261e-29■■■■■ 39.6
PRPF8Q6P2Q9 CBX4-203ENST00000494546 432 ntTSL 328.2■■■□□ 2.112e-8■■■■■ 39.6
PRPF8Q6P2Q9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.522e-8■■■■■ 39.6
PRPF8Q6P2Q9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.882e-8■■■■■ 39.6
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PRPF8Q6P2Q9 PSMD11-209ENST00000580904 540 ntTSL 45.88□□□□□ -1.476e-10■■■■■ 39.6
PRPF8Q6P2Q9 CENPO-203ENST00000395845 854 ntTSL 311.95□□□□□ -0.58e-7■■■■■ 39.6
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PRPF8Q6P2Q9 PLCB1-208ENST00000487210 4781 ntTSL 1 (best)3.18□□□□□ -1.92e-9■■■■■ 39.6
PRPF8Q6P2Q9 TFRC-210ENST00000465288 560 ntTSL 57.18□□□□□ -1.266e-8■■■■■ 39.6
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