Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCSAPQ6IQ19 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCSAPQ6IQ19 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCSAPQ6IQ19 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCSAPQ6IQ19 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCSAPQ6IQ19 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCSAPQ6IQ19 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCSAPQ6IQ19 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms