Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF18Q5VWM3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms