Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GARNL3Q5VVW2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GARNL3Q5VVW2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GARNL3Q5VVW2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GARNL3Q5VVW2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GARNL3Q5VVW2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GARNL3Q5VVW2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GARNL3Q5VVW2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GARNL3Q5VVW2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GARNL3Q5VVW2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GARNL3Q5VVW2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GARNL3Q5VVW2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GARNL3Q5VVW2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GARNL3Q5VVW2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GARNL3Q5VVW2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GARNL3Q5VVW2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GARNL3Q5VVW2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GARNL3Q5VVW2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GARNL3Q5VVW2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 452 ms