Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
STRIP1Q5VSL9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STRIP1Q5VSL9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms