Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HES3Q5TGS1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms