Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf116Q5BN46 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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