Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAN3Q58A45 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PAN3Q58A45 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAN3Q58A45 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAN3Q58A45 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAN3Q58A45 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAN3Q58A45 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAN3Q58A45 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAN3Q58A45 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAN3Q58A45 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAN3Q58A45 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAN3Q58A45 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAN3Q58A45 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAN3Q58A45 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAN3Q58A45 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAN3Q58A45 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAN3Q58A45 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PAN3Q58A45 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAN3Q58A45 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAN3Q58A45 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAN3Q58A45 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms