Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
CDCA8Q53HL2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDCA8Q53HL2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms