Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS7

GLE1, Nucleoporin GLE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLE1Q53GS7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GLE1Q53GS7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms