Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms