Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY00

TSGA10IP, Testis-specific protein 10-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA10IPQ3SY00 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSGA10IPQ3SY00 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSGA10IPQ3SY00 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms