Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
KRTAP13-4Q3LI77 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms