Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NBPF1Q3BBV0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NBPF1Q3BBV0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms