Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKIDA1Q1XH10 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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