Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UPP1Q16831 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UPP1Q16831 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UPP1Q16831 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPP1Q16831 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPP1Q16831 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPP1Q16831 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms