Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PMS2P3Q13401 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
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PMS2P3Q13401 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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PMS2P3Q13401 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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PMS2P3Q13401 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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PMS2P3Q13401 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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PMS2P3Q13401 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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PMS2P3Q13401 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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PMS2P3Q13401 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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PMS2P3Q13401 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P3Q13401 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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