Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLAMF1Q13291 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLAMF1Q13291 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLAMF1Q13291 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLAMF1Q13291 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLAMF1Q13291 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLAMF1Q13291 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLAMF1Q13291 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SLAMF1Q13291 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLAMF1Q13291 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLAMF1Q13291 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLAMF1Q13291 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLAMF1Q13291 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLAMF1Q13291 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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