Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.086e-6■■□□□ 13
G3BP1Q13283 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.356e-6■■□□□ 13
G3BP1Q13283 RALGAPB-204ENST00000438490 4075 ntTSL 55.51□□□□□ -1.536e-6■■□□□ 13
G3BP1Q13283 RALGAPB-209ENST00000632792 4858 ntTSL 55.37□□□□□ -1.556e-6■■□□□ 13
G3BP1Q13283 PDXDC1-214ENST00000566633 2597 ntTSL 213.15□□□□□ -0.32e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 PRKAR1A-210ENST00000585981 995 ntTSL 510.26□□□□□ -0.778e-9■■□□□ 13
G3BP1Q13283 KDM5B-210ENST00000602511 542 ntTSL 510.1□□□□□ -0.796e-8■■□□□ 13
G3BP1Q13283 KDM5B-206ENST00000470573 535 ntTSL 48.55□□□□□ -1.046e-8■■□□□ 13
G3BP1Q13283 LRPPRC-208ENST00000472420 694 ntTSL 28.38□□□□□ -1.071e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 LRPPRC-209ENST00000483489 564 ntTSL 25.23□□□□□ -1.571e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.625e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.575e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 BZW1-208ENST00000452206 1059 ntTSL 516.55■□□□□ 0.245e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 BZW1-204ENST00000410110 1075 ntTSL 512.84□□□□□ -0.355e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.955e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 BZW1-207ENST00000450637 578 ntTSL 48.96□□□□□ -0.985e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 BZW1-205ENST00000419090 557 ntTSL 37.18□□□□□ -1.265e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 MDH1-202ENST00000409476 808 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.267e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 MDH1-203ENST00000409908 700 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.267e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 MDH1-216ENST00000544381 1346 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.437e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 MDH1-201ENST00000233114 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.517e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 MDH1-215ENST00000539945 1443 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.517e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 SNRNP200-208ENST00000497539 2666 ntTSL 1 (best)13.97□□□□□ -0.171e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 TOM1-207ENST00000439512 800 ntTSL 320.47■□□□□ 0.873e-6■■□□□ 13
G3BP1Q13283 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.471e-6■■□□□ 13
G3BP1Q13283 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.092e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.782e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.642e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 RPS9-209ENST00000448962 2384 ntTSL 218.65■□□□□ 0.582e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 RPS9-210ENST00000460761 644 ntTSL 217.91■□□□□ 0.462e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.392e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 RPS9-206ENST00000436445 752 ntTSL 217.5■□□□□ 0.392e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 RPS9-208ENST00000445961 944 ntTSL 517.5■□□□□ 0.392e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.382e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 RPS9-211ENST00000484121 897 ntTSL 216.76■□□□□ 0.272e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.252e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.112e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 RPS9-212ENST00000495002 956 ntTSL 1 (best)15.67■□□□□ 0.12e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 RALY-209ENST00000489384 227 ntTSL 38.28□□□□□ -1.081e-10■■□□□ 13
G3BP1Q13283 CORO1C-219ENST00000552871 587 ntTSL 322.58■■□□□ 1.212e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 BAG6-258ENST00000464126 609 ntTSL 218.31■□□□□ 0.522e-10■■□□□ 13
G3BP1Q13283 BAG6-237ENST00000375976 3644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.11e-8■■□□□ 13
G3BP1Q13283 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.131e-8■■□□□ 13
G3BP1Q13283 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.151e-8■■□□□ 13
G3BP1Q13283 BAG6-234ENST00000211379 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.271e-8■■□□□ 13
G3BP1Q13283 BAG6-236ENST00000375964 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.321e-8■■□□□ 13
G3BP1Q13283 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.296e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.216e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 AHCYL1-201ENST00000359172 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.46e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.245e-8■■□□□ 13
G3BP1Q13283 HNRNPL-212ENST00000601449 1918 ntTSL 521.02■□□□□ 0.965e-8■■□□□ 13
G3BP1Q13283 HNRNPL-202ENST00000388749 1952 ntTSL 512.83□□□□□ -0.355e-8■■□□□ 13
G3BP1Q13283 PSMC5-207ENST00000580063 562 ntTSL 214.89□□□□□ -0.035e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 HNRNPA2B1-207ENST00000495810 482 ntTSL 213.04□□□□□ -0.326e-9■■□□□ 13
G3BP1Q13283 SF3B3-202ENST00000562722 881 ntTSL 216.02■□□□□ 0.165e-8■■□□□ 13
G3BP1Q13283 PABPC1-216ENST00000520868 971 ntTSL 57.07□□□□□ -1.281e-10■■□□□ 13
G3BP1Q13283 PABPC1-206ENST00000518293 608 ntTSL 33.73□□□□□ -1.811e-10■■□□□ 13
G3BP1Q13283 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.814e-9■■□□□ 13
G3BP1Q13283 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.694e-9■■□□□ 13
G3BP1Q13283 QARS-228ENST00000634432 582 ntTSL 312.53□□□□□ -0.49e-7■■□□□ 13
G3BP1Q13283 C1QBP-204ENST00000573406 767 ntTSL 224.17■■□□□ 1.463e-9■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 KPNB1-208ENST00000580019 427 ntTSL 23.65□□□□□ -1.837e-7■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.367e-8■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.127e-8■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.097e-8■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 TPI1-207ENST00000493987 839 ntTSL 313.47□□□□□ -0.253e-9■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 ACTN1-201ENST00000193403 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.291e-7■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 ACTN1-203ENST00000394419 3464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.371e-7■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.255e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.673e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.643e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.233e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.123e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.13e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 EIF3M-210ENST00000531921 1697 ntTSL 221.45■■□□□ 1.023e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.93e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 EIF3M-212ENST00000532444 633 ntTSL 520.48■□□□□ 0.873e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 SNRPD3-204ENST00000439775 640 ntTSL 320.11■□□□□ 0.813e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 PRRC2A-204ENST00000462617 1015 ntTSL 520.06■□□□□ 0.83e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.783e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.753e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 EIF3M-201ENST00000323213 889 ntTSL 519.43■□□□□ 0.73e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.643e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 EIF3M-213ENST00000533439 749 ntTSL 518.37■□□□□ 0.533e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.423e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 AP2B1-209ENST00000592167 461 ntTSL 417.21■□□□□ 0.353e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 PRRC2A-214ENST00000492691 1118 ntTSL 215.53■□□□□ 0.083e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 AEN-203ENST00000557927 5039 ntTSL 1 (best)15.18■□□□□ 0.023e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 EIF3M-205ENST00000525782 2236 ntTSL 214.64□□□□□ -0.073e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 AP1B1-211ENST00000482818 3560 ntTSL 1 (best)14.28□□□□□ -0.123e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 AP2B1-205ENST00000590432 554 ntTSL 414.25□□□□□ -0.133e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 PRRC2A-209ENST00000482441 719 ntTSL 214□□□□□ -0.173e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 POLR3A-205ENST00000616246 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.283e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 ANKRD17-205ENST00000513908 852 ntTSL 212.76□□□□□ -0.373e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 EIF3M-202ENST00000524711 1645 ntTSL 212.76□□□□□ -0.373e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 SNRPD3-203ENST00000404603 715 ntTSL 510.37□□□□□ -0.753e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 AP2B1-206ENST00000590538 568 ntTSL 410.18□□□□□ -0.783e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 KIAA0100-209ENST00000580395 577 ntTSL 210.08□□□□□ -0.83e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 AP2B1-208ENST00000591610 559 ntTSL 49.35□□□□□ -0.913e-6■■□□□ 12.9
G3BP1Q13283 PPP2R5D-209ENST00000486843 462 ntTSL 39.29□□□□□ -0.923e-6■■□□□ 12.9
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 105.8 ms